破解“生命暗物质”,单细胞原位代谢图谱国际科学计划助力环境可持续发展

1027日,“环境可持续单细胞原位代谢图谱(iMAPS-ES)国际科学计划研讨会”依托中国生态学学会微生物生态专业委员会年会顺利召开。来自全球顶尖高校、科研机构及工业领域的近150名专家学者齐聚青岛,共同启动了iMAPS-ES国际科学计划。

本次研讨会由青岛能源所单细胞中心徐健研究员主持。美国俄克拉荷马大学周集中教授、英国牛津大学黄巍教授、加利福尼亚大学圣地亚哥分校Rob Knight教授、上海交通大学唐鸿志教授等,分别阐述了微生物生态学面临的挑战与机遇、单细胞拉曼技术的历史与前景、元拉曼组对地球微生物组计划的意义以及iMAPS-ES对环境可持续发展的贡献。作为iMAPS-ES国际科学计划的工业界创始成员之一,宝洁公司全球织物护理研究院的首席科学家汤鸣和岳峰研究员,剖析了iMAPS-ES对于织物、家居和个人清洁护理产业的深远意义。徐健介绍了“单细胞原位代谢图谱(iMAPS)”国际科学计划的科学使命与组织架构,以及支撑该计划的元拉曼组仪器体系与微生物组探测(MEx)科学设施。

与会者们围绕iMAPS-ES国际科学计划的科学使命、产业需求、核心技术、装备平台、典型应用、合作机制等,展开了热烈讨论,并重点针对土壤、水体、森林、草地等典型生态系统,探讨了微生态健康快速评估、原位功能菌快速识别和挖掘、基于原位功能菌的生态系统高效修复等应用。

iMAPS国际科学计划旨在通过代谢功能靶向性单细胞多组学这一创新科学思路,在单细胞精度、以“穷尽式”方式,回答微生物组的“6W”问题:即“谁(Who)、在做什么(What,即原位代谢)、为什么(Why)、财富(Wealth,即活菌资源)、何时(When)、何地(Where)”。支撑这一科学使命的是以高通量拉曼流式细胞分选仪为代表的元拉曼组仪器系列。

依托源于青岛能源所的原创仪器,iMAPS国际科学计划将面向生物制造/合成生物学、农业、环境、疾控、健康等各领域中微生物资源监测、筛选、改造、设计与合成等环节的共性瓶颈,建立代谢功能靶向性的单细胞多组学与活菌挖掘装备及数据体系。

此次在青岛启动的iMAPS-ES,是iMAPS国际科学计划中针对环境可持续发展领域的版块。前期,青岛能源所与中国疾病预防控制中心国家病原微生物资源库、中国农业科学院农业资源与农业区划研究所等合作,已陆续启动“病原拉曼组引擎行动(P.R.E.P.)”、“农业微生物组单细胞代谢图谱计划(Agri-MAPS)”等版块。

下一步,iMAPS国际科学计划将通过合作建设大规模、高通量、一体化、网络式的微生物组探测(MEx)科学设施,开展全微生态系统范围、单细胞精度、穷尽式的微生物组“代谢体检”和“原位代谢功能先筛后养”,联合推动国际人类/地球微生物组计划等进入“单细胞代谢实时监测、原位功能菌随地挖掘”的新阶段。

iMAPS国际科学计划代表着微生态方法学在四个方向的发展趋势:从基因组到代谢表型组、从群体到单细胞精度、从纯培养后的功能测量到原位功能测量、从资源监测与挖掘的割裂到资源监测与挖掘的一体化,同时也将促进我国生命科学高端仪器产业的发展。(文/图 刘阳)


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