6月1日，在2024第三届全国生物资源管理与利用学术大会上，由中国疾病预防控制中心、中国科学院青岛生物能源与过程研究所、中国科学院微生物研究所联合发起的“病原拉曼组引擎行动（Pathogen Ramanomics Engine Project，P.R.E.P.）”倡议正式启动。P.R.E.P.旨在针对生物资源领域国家战略需求的共性科学问题与技术瓶颈，通过产学研协同创新，开展以“拉曼组”为核心的病原单细胞多组学研发和应用示范，抢占国际科学技术创新制高点，加速传染病防控相关装备与大数据体系的原始创新与成果转化，用新质生产力推动生物资源的管理与应用，实现核心科技的自立自强。

从2003年的SARS到2019年的新冠病毒感染，面对未知的传染病挑战，亟需建立智慧化传染病防控的新范式，构建多点触发的智慧化防控体系，提升传染病全流程防控能力。

单个细胞是众多病原体的功能单元和进化单位，构建单细胞精度的病原体代谢表型组和基因组的方法学体系与数据框架，对于及时发现病原中的“黑天鹅”，并防范“灰犀牛”事件至关重要。拉曼组作为P.R.E.P.项目的核心支撑技术，能够在单菌体精度下全面表征细胞多维、复杂的表型，具有广谱适用、活体、原位、非标记、全景式采集、可分辨复杂功能、快速、高通量、低成本、无缝对接下游测序/质谱/培养等重要优势，因此有望在传染病防控中发挥重要作用。

中国疾病预防控制中心国家病原微生物资源库魏强研究员在大会上阐述了P.R.E.P.“一个建立、三个提升”的核心使命。首先，“建立”是指要建立四个“单细胞精度”能力，即病原单细胞的拉曼高通量采集与分选能力（鉴定）、全基因组测序能力（溯源）、药敏快速评估能力（防治）和培养能力（利用）；其次，三个“提升”指提升病原微生物的发现与挖掘能力、资源保藏与利用能力以及重大传染病的监测与预警能力。

与此对应，拉曼组引擎行动的四大任务是：研发病原拉曼组仪器装备、制定病原拉曼组技术标准（构建拉曼技术标准体系）、研发病原拉曼组分析工具以及建立病原拉曼组数据库（基本数据库、功能数据库）。

青岛能源所徐健研究员进行了“单细胞精度的微生物资源‘代谢功能’探测与挖掘：从scRACS-Seq/Culture到FlowRACS”的专题分享。他从拉曼组的科学内涵入手，介绍了高通量流式拉曼细胞分选仪等国产原创科学仪器对于拉曼组高通量大规模采集的根本性支撑作用，并分享了在病原单细胞精度鉴定、药敏、溯源、培养等方面的应用案例。他指出，基于“共建、共享”的原则，拉曼组引擎将成为一种全新的研究思路、技术体系和数据框架，在“最深”的水平服务各种疾控场景。

微生物所付钰研究员做了题为“拉曼光谱结合人工智能单细胞水平鉴定和表征微生物”的分享。他指出，拉曼光谱是化学物质的“指纹图谱”，在光镊技术的配合下，单细胞拉曼光谱能够在不损伤细胞的情况下鉴定和表征微生物单细胞的生理生化表型，并就人工智能帮助下单细胞拉曼光谱在病原微生物鉴定、鲍曼不动菌抗生素耐药特征表征、“超级真菌”耳念珠菌临床特征表征、微生物代谢产物表征等方面的应用展开介绍。

生物资源库单细胞技术计划（Alliance of Single-cell Technology-Culturebanks，A-STEC）致力于通过单细胞技术平台的共研、共建和共享，联合推动生物资源库建设和运行领域进入“单细胞时代”。作为A-STEC中率先启动的联合行动，P.R.E.P.有望在未来的传染病防控中发挥关键作用，为人类健康贡献原创的中国智慧和中国方案。（文/刘阳 图/第三届全国生物资源管理与利用学术大会）